生命科学学院伊成器研究组在Nature Methods发表“表观转录组分析”综述
导读| 伊成器,北京大学生命科学院研究员。
2005年毕业于中国科学技术大学化学系;
2010年毕业于芝加哥大学化学系;
2012年入选“青年千人计划”;
2016年荣获国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目。
其研究组主要致力于DNA/RNA修饰及去修饰的生物学通路、功能和机制研究。去年这一研究组也在Nature Methods发文,报道了一种通过化学标记和富集手段,首次实现了免亚硫酸氢盐处理(bisulfite-free)的5-醛基胞嘧啶(5fC)单碱基分辨率、全基因组水平测序。
表观转录组学是近年来兴起的前沿科研领域,目前已知的转录后修饰已有一百多种,阅微基因作为科研领域技术服务的提供者,专门从事表观遗传学、高通量测序、基因表达方面的技术服务,加速科学工作者的研究进程!!
2016年12月29日,北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在NatureMethods杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies:decoding RNA modifications”的综述论文(doi:10.1038/nmeth.4110)。
表观转录组学(epitranscriptomics,又称“RNA表观遗传学”)是近年来兴起的前沿科研领域。目前已知的转录后修饰已有一百多种,并且这当中许多修饰都能够参与真核生物基因表达的调控。在表观转录组学的研究当中,RNA修饰全转录组水平检测技术的发展至关重要。本论文对于真核生物mRNA上已知的几种主要修饰(包括N6-methyladenosine、N6,2’-O-dimethyladenosine、5-methylcytidine、5-hydroxylmethylcytidine、inosine,pseudouridineandN1-methyladenosine)的检测技术进行了综述,并且对目前表观转录组分析技术存在的挑战及未来的发展方向进行了展望。
本期NatureMethods杂志将“表观转录组分析”(Epitranscriptomeanalysis)评选为2016年的年度方法;伊成器研究组在该领域发表的两项化学生物学新技术【Nat.Chem.Biol.11,592–597(2015);Nat.Chem.Biol.12,311–316(2016)】也被年度方法所提及。
北京大学生命科学学院博士生李笑雨(PTN-BBS联合培养项目)、北大-清华生命科学联合中心博士生熊旭深参与了论文的写作;生命科学学院伊成器研究员是该论文的通讯作者。该文章得到了国家自然科学基金、科技部“973”计划和北大-清华生命科学联合中心的资助。
mRNA上的化学修饰(图源于NatureMethods)